环氧乙烷气体易燃、易爆、且对人有毒，所以必须在密闭的环氧乙烷灭菌器内进行。
就像我们平时常用的口罩在使用前必须经过环氧乙烷灭菌，灭菌后需放置半个月以上，有利于环氧乙烷的挥发，还必须测定环氧乙烷含量，达到标准后方可使用。
环氧乙烷是一种广谱高效的气体消毒剂，对物品有很强的杀菌渗透能力，能杀死物品深处的病原微生物，包括细菌繁殖体，孢子，病毒和真菌等，在医学上被广泛使用。是目前最主要的低温灭菌方法之一。
环氧乙烷灭菌
环氧乙烷灭菌物品准备与包装：需灭菌的物品必须清洗干净，注意不能用生理盐水清洗，灭菌物品上不能有水滴或水分太多，以免造成环氧乙烷稀释和水解。环氧乙烷几乎可用于所有医疗用品的灭菌，但不适用于食品、液体、油脂类、滑石粉和动物饲料等的灭菌，适合于环氧乙烷灭菌的包装材料有纸、复合透析纸、布、无纺布、通气型硬质容器、聚乙烯等；不能用于环氧乙烷灭菌的包装材料有金属箔、聚氯乙烯、玻璃纸、尼龙、聚酯、聚偏二氯乙烯、不能通透的聚丙烯。改变包装材料应作验证，以保证被灭菌物品灭菌的可靠性。
环氧乙烷灭菌程序需包括预热、预湿、抽真空、通入气化环氧乙烷达到预定浓度、维持灭菌时间、清除灭菌柜内环氧乙烷气体、解析以去除灭菌物品内环氧乙烷的残留。
